第114章 DNA与人工智能的关联(一) (1/2)
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什么是折叠密码呢?
蛋白质工程领域将研究蛋白质折叠的过程定义为破译“第二遗传密码”——折叠密码(foldingcode)的过程。
蛋白质的基本单位为氨基酸,而蛋白质的一级结构指的就是其氨基酸序列,蛋白质会由所含氨基酸残基的亲水性、疏水性、带正电、带负电……等等特性通过残基间的相互作用而折叠成一立体的三级结构。
虽然蛋白质可在短时间中从一级结构折叠至立体结构,前世的研究者们却限于眼界与学识及设备等等制栲,暂时无法在短时间中从氨基酸序列计算出蛋白质结构,甚至无法得到准确的三维结构。
而蛋白质折叠的研究,比较狭义的定义就是研究蛋白质特定三维空间结构形成的规律、稳定性和与其生物活性的关系。
在概念上有热力学的问题和动力学的问题;蛋白质在体外折叠和在细胞内折叠的问题;有理论研究和实验研究的问题。
这里最根本的科学问题就是多肽链的一级结构到底如何决定它的空间结构?既然前者决定后者,一级结构和空间结构之间肯定存在某种确定的关系,这是否也像核苷酸通过“三联密码”决定氨基酸顺序那样有一套密码呢?
所以。前世有人把这设想的一级结构决定空间结构的密码叫作“第二遗传密码”。
据克里斯琴·b·安芬森(1972年的诺贝尔化学奖得主)的研究,蛋白质可由加热或置于某些化学环境而变性,三级结构解体;而当环境回复到原本的状态时,蛋白质可于不到一秒的时间折叠至原先的立体结构,不论试验几次,蛋白质都仅此一种立体结构,于是anfinsen提出一个结论:蛋白质分子的一级结构决定其立体结构。
,因为蛋白质的功能取决于其立体结构,而目前根据已知某基因序列可翻译获得对应蛋白质的氨基酸序列,既蛋白质的一级结构;如果从蛋白质的一级结构就能知道立体结构,那么即可直接从基因推测其编码蛋白质所对应的生物学功能。
虽然蛋白质可在短时间中从一级结构折叠至立体结构,研究者却无法在短时间中从氨基酸序列计算出蛋白质结构,甚至无法得到准确的三维结构。
因此,研究蛋白质折叠的过程,可以说是破译“第二遗传密码”——折叠密码(foldingcode)的过程。
研究蛋白质的折叠,在前世是生命科学领域的前沿课题之一。
而蛋白质是一种生物大分子,基本上是由20种氨基酸以肽键连接成肽链。肽链在空间卷曲折叠成为特定的三维空间结构,包括二级结构和三级结构二个主要层次。
甚至,有的蛋白质由多条肽链组成,每条肽链称为亚基,亚基之间又有特定的空间关系,称为蛋白质的四级结构。所以蛋白质分子有非常特定的复杂的空间结构。
而生存在地球地上的脯乳动物们,有许许多多的病症,都是由于蛋白质的折叠这个罪魁祸首引起的,而且,不可治愈和预防。
疯牛病、老年性痴呆症、囊性纤维病变、家族性高胆固醇症、家族性淀粉样蛋白症、某些肿瘤、白内障等等都是属于这样的“折叠病”。
究其原因,就是因为相关蛋白质的三维空间结构异常。
而这种三维空间结构异常,是由于致病蛋白质分子通过分子间作用,感染正常蛋白质而造成的。但是,请注意,致病蛋白质分子与正常蛋白质分子的构成完全相同,只是空间结构不同。
终上所述,无论是基因dna序列之间的‘句号’,还是蛋白质折叠引起的‘折叠病,这样如此明显的特征,都让杨小乐不由自主地想起在编写软件的时候,那成千上百万行的程序里,每一行的程序旁边,都会有注释存在。
如果把每一个dna序列看成是一行程序,那个‘句号’看成是注释,那么按照编程的写法排列,那么人类这些基因序列,是不是就是一长串的程序呢?
按照基因的说法,这些基因决定了我们身体的所有血肉、骨骼、神经、器官、相貌、甚至还是智商等等,从一... -->>
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什么是折叠密码呢?
蛋白质工程领域将研究蛋白质折叠的过程定义为破译“第二遗传密码”——折叠密码(foldingcode)的过程。
蛋白质的基本单位为氨基酸,而蛋白质的一级结构指的就是其氨基酸序列,蛋白质会由所含氨基酸残基的亲水性、疏水性、带正电、带负电……等等特性通过残基间的相互作用而折叠成一立体的三级结构。
虽然蛋白质可在短时间中从一级结构折叠至立体结构,前世的研究者们却限于眼界与学识及设备等等制栲,暂时无法在短时间中从氨基酸序列计算出蛋白质结构,甚至无法得到准确的三维结构。
而蛋白质折叠的研究,比较狭义的定义就是研究蛋白质特定三维空间结构形成的规律、稳定性和与其生物活性的关系。
在概念上有热力学的问题和动力学的问题;蛋白质在体外折叠和在细胞内折叠的问题;有理论研究和实验研究的问题。
这里最根本的科学问题就是多肽链的一级结构到底如何决定它的空间结构?既然前者决定后者,一级结构和空间结构之间肯定存在某种确定的关系,这是否也像核苷酸通过“三联密码”决定氨基酸顺序那样有一套密码呢?
所以。前世有人把这设想的一级结构决定空间结构的密码叫作“第二遗传密码”。
据克里斯琴·b·安芬森(1972年的诺贝尔化学奖得主)的研究,蛋白质可由加热或置于某些化学环境而变性,三级结构解体;而当环境回复到原本的状态时,蛋白质可于不到一秒的时间折叠至原先的立体结构,不论试验几次,蛋白质都仅此一种立体结构,于是anfinsen提出一个结论:蛋白质分子的一级结构决定其立体结构。
,因为蛋白质的功能取决于其立体结构,而目前根据已知某基因序列可翻译获得对应蛋白质的氨基酸序列,既蛋白质的一级结构;如果从蛋白质的一级结构就能知道立体结构,那么即可直接从基因推测其编码蛋白质所对应的生物学功能。
虽然蛋白质可在短时间中从一级结构折叠至立体结构,研究者却无法在短时间中从氨基酸序列计算出蛋白质结构,甚至无法得到准确的三维结构。
因此,研究蛋白质折叠的过程,可以说是破译“第二遗传密码”——折叠密码(foldingcode)的过程。
研究蛋白质的折叠,在前世是生命科学领域的前沿课题之一。
而蛋白质是一种生物大分子,基本上是由20种氨基酸以肽键连接成肽链。肽链在空间卷曲折叠成为特定的三维空间结构,包括二级结构和三级结构二个主要层次。
甚至,有的蛋白质由多条肽链组成,每条肽链称为亚基,亚基之间又有特定的空间关系,称为蛋白质的四级结构。所以蛋白质分子有非常特定的复杂的空间结构。
而生存在地球地上的脯乳动物们,有许许多多的病症,都是由于蛋白质的折叠这个罪魁祸首引起的,而且,不可治愈和预防。
疯牛病、老年性痴呆症、囊性纤维病变、家族性高胆固醇症、家族性淀粉样蛋白症、某些肿瘤、白内障等等都是属于这样的“折叠病”。
究其原因,就是因为相关蛋白质的三维空间结构异常。
而这种三维空间结构异常,是由于致病蛋白质分子通过分子间作用,感染正常蛋白质而造成的。但是,请注意,致病蛋白质分子与正常蛋白质分子的构成完全相同,只是空间结构不同。
终上所述,无论是基因dna序列之间的‘句号’,还是蛋白质折叠引起的‘折叠病,这样如此明显的特征,都让杨小乐不由自主地想起在编写软件的时候,那成千上百万行的程序里,每一行的程序旁边,都会有注释存在。
如果把每一个dna序列看成是一行程序,那个‘句号’看成是注释,那么按照编程的写法排列,那么人类这些基因序列,是不是就是一长串的程序呢?
按照基因的说法,这些基因决定了我们身体的所有血肉、骨骼、神经、器官、相貌、甚至还是智商等等,从一... -->>
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